基因检测之样本选择——胸腹水不可忽视

随着靶向疗法和癌症免疫疗法的兴起，在接受治疗之前对肿瘤进行基因检测变得越来越重要。基因检测，样本的选择也是至关重要的。与传统的组织活检相比，液体活检具备无侵入性、实时动态监测、克服肿瘤异质性以及提供全面检测信息等独特优势。凭借更方便，操作风险更小，可以反映患者全部肿瘤更全面的信息等优势，液体活检近几年来受到越来越多的重视。

广义上，液体活检是指从血液、唾液、尿液、腹水、胸水等体液中以非侵入性方式检测生物标记物的技术。血液样本大家了解的比较多，今天我们的主角是胸腹水。

胸腹水

常见肿瘤并发症，胸腔/腹腔内肿瘤病灶释放的肿瘤细胞和肿瘤DNA会存在于胸水/腹水中，并且有时跟血液相比浓度更高，因此引流的新鲜胸水/腹水也可用来做基因检测。常见肿瘤为肺癌/乳腺癌/胃肠癌/肝癌等。对于肺癌来说，胸水样本不可忽视，有报道称约50%以上的肺癌患者在疾病过程中出现胸腔积液(胸水)。一旦出现，患者的生活质量将会受到明显的影响，容易出现发热、胸闷、呼吸困难等现象。

胸水根据来源可分为两种

渗出性胸水

恶性胸水，多为一侧，常为血红色，能自凝，沉淀多;是肿瘤直接侵犯胸膜或在胸膜上广泛转移，使胸膜表面毛细血管通透性增加，大量体液渗至胸腔。

漏出性胸水

非恶性胸水，多为双侧，常为淡黄色，不自凝，沉淀少;是纵膈淋巴结广泛转移，导致淋巴管回流受阻而引起的，多为漏出液，这种胸水的构成成分也比较正常。

由于胸水样本的差异较大，有些胸水中肿瘤细胞含量极少，因此建议多采集胸水进行富集，同时用硬质容器装纳并且尽快处理。如果没有条件进行胸水细胞的富集或者胸水沉淀包埋的蜡块中没有肿瘤细胞，那么是否可以用胸水上清中的游离肿瘤DNA进行基因检测呢?答案是可以的。

随着基因组学研究的快速发展及NGS检测技术的重大突破，科学家和研究者们已经证实胸水上清也是一种重要的液体活检媒介，突变检出率可能优于细胞沉渣，更能反映局部病灶的突变情况。更有研究显示胸水上清中的ctDNA浓度比血液中的ctDNA浓度更高(即便胸水沉渣中没有找到肿瘤细胞也可以做);并且与组织标本检测的一致性也较高，能很好的解决肿瘤的异质性问题。

第18届世界肺癌大会(WCLC)上，就有研究证实胸水上清ctDNA具有更高的肿瘤特有突变检出率和敏感性。今年，该项研究结果正式发表，进而证实了胸水上清标本进行基因检测的有效性和准确性，并进一步证实胸水上清标本在临床应用的可能性。

研究显示胸水上清中ctDNA含量远高于胸水沉渣细胞DNA，并且具有更高的突变检出率及更高的突变检出丰度：胸水上清(98.4%)>胸水细胞(90.5%)，胸水上清可克服胸水细胞学阴性和血性胸水检测突变的困难。即使是细胞学阴性，胸水上清仍可能检出突变;即使是血性胸水含有有核细胞，导致肿瘤细胞被稀释而降低胸水细胞沉渣的突变检测敏感性，但胸水上清的检出率并不受影响。也说明胸水上清DNA 是肿瘤DNA的独立来源，受肿瘤细胞丰度影响较小。

另一项研究采用二代测序(NGS)方法检测肺腺癌患者(n=150)的胸水上清液进行基因突变检测。结果得出一致结论：胸水上清液进行分子基因检测使常规基因检测变得方便。其中高度富含新鲜肿瘤DNA，可以为肺癌基因检测提供有价值的标本。特别是对于肿瘤组织不足的患者，可降低基因检测的失败率，缩短检测周期，避免重复活检。因此对于无法使用组织检测的患者而言，肿瘤恶性胸水上清检测可能也不失为一种选择。

随着分子病理技术的不断进步和胸腔积液处理方法的不断完善，胸水上清作为液体活检的新方法，可以提供具有代表性的肿瘤基因组信息，为临床精准治疗提供参考价值。